Виктор У. Вы же сами ответили на вопрос)
- При проведении проверки знаний должно присутствовать не менее трех членов комиссии организации по проверке знаний, включая председателя (заместителя председателя).
А каким способом проводить эту проверку, разъясняет п.60.
Вспомните экзамен в РТН, садимся за комп, присутствуют члены комиссии. Понятно, что почти ни на одном предприятии не делают так, а председатель просто ставит подпись в уже готовых документах, но вопрос звучал "как правильно", а правильно - должны присутствовать