Евген64 всё зависит от вида деятельности.
Посмотрите ТК РФ ст 220. Медицинские осмотры некоторых категорий работников
Работники, занятые на работах с вредными и (или) опасными условиями труда (в том числе на подземных работах), а также на работах, связанных с движением транспорта, проходят обязательные предварительные (при поступлении на работу) и периодические (в течение трудовой деятельности, для лиц в возрасте до 21 года - ежегодные) медицинские осмотры для определения пригодности этих работников для выполнения поручаемой работы и предупреждения профессиональных заболеваний. В соответствии с нормативными правовыми актами и (или) медицинскими рекомендациями указанные работники проходят внеочередные медицинские осмотры.
Работники организаций пищевой промышленности, общественного питания и торговли, водопроводных сооружений, медицинских организаций и детских учреждений, а также некоторых других работодателей проходят указанные медицинские осмотры в целях охраны здоровья населения, предупреждения возникновения и распространения заболеваний.
Таким образом, некоторые категории по виду деятельности не привязаны к СОУТ, всё равно проходят.
Насчет того, как написали выше - отправляем просто сами, по решению работодателя. У меня так же бывает, но у нас ООО. Было обсуждение, не смогу сейчас найти, что бюджетников и крупный бизнес за это кошмарит налоговая как нецелевое расходование средств.