Если я понимаю корректно, то для выполнения разовых работ = по наряд-допуску необходимо провести целевой инструктаж (проводит его руководитель работ). А стажировку работника курирует руководитель сотрудника.
На мой взгляд, эти два человека несовместимы.
И стажировка должна проводится на рабочем месте, а работы по наряд-допуску предполагают выход за рамки рабочего места (например ПРР).
Про перечень работников, которым нужно проходить стажировку, думаю имеется в виду, те работники, которые на постоянной основе выполняют работы повышенной опасности, не по наряд-допуску=не разовые.