Оксана Здравствуйте.
1.Если в ТД прописана дистанционная работа, то СОУТ не нужна. Если не прописана, то укажите РМ в офисе (если такое имеется), либо внесите изменения в ТД, прописав дистанционную работу. Личное авто можно не указывать в СОУТ.
2.Проведение СОУТ на РМ в офисе, посещение территории в оценку вряд ли войдет, не сильно это влияет на УТ (тем более выход на территорию 1 раз в месяц).
3.Проблемы сразу возникают с неофициальным трудоустройством по охране труда (если вдруг НС с ним случится), так что лучше оформить с ним ТД и провести СОУТ.
Машинист автокрана - это 1 РМ с несколькими рабочими зонами.