Исходя из того, что обязательный медицинский осмотр необходимо пройти как по основной должности, так и по совместительству, и чтобы избежать возможных вопросов у принципиальных проверяющих в будущем, и ,не дай бог, травма какая-нибудь по совмещенной должности, можно и 2 бумажки оформить....