В своих организациях провожу примерно так - смотрю какую работу выполняют + осмотр помещений где работают + разговор с руководителем и работниками (в случае если есть, например, нагрузки на голосовой аппарат (служба поддержки, продажники и т.п.) или для выполнения работы нужно передвигаться по городу). Обучно такая беседа занимает отсилы минуты 2-3 (при этом не обязательно со всеми работниками беседовать, достаточно рукля и 1-2 работника). Анкетами заморачиваться не стала - штат не большой.
В ваших же условиях, если штат большой, можно разработать мини-анкеты, но предварительно определив кто с чем работает у кого какой фактор и нагрузка может быть. Ну например, хирург - помимо осмотра, где он может сидеть, проводит операции, на которых он стоит. Вот и выяснить сколько процентов времени он работает стоя (кстати, в этих моментах еще СОУТ поможет). Делать большие анкеты с кучей вопросов не советую, могут либо послать либо заполнить на авось