Сотрудники организации, проводящей обучение по охране труда, являющиеся ЧАК должны проходить проверку знаний в системе ЕСИОТ. В том содержании протоколов, которое представлено в 2464 не указано, что необходимо проставлять какие то пометки о том, где проходила проверка знаний. То есть в принципе протокол от учебного центра ничем отличаться не должен от протокола внутреннего обучения. Единственное что могу вам посоветовать, это распечатать протоколы с ЕСИОТ после прохождения там тестирования, и приложить их к протоколам из учебного центра.
О том из каких подразделений должны быть ЧАК никаких требований ни в 2464 ни в 2334 (об акредитации) нет. Есть только требования к наличию двух обучающих сотрудников.