1QAZSE4 здравствуйте!
Ваша ситуация - это ст. 60.2 ТК РФ Совмещение профессий (должностей). Совмещать может только ваш штатный сотрудник в своё рабочее время, не сверх.
Оформлен по допнику к основному ТД - всё верно.
А вот отсутствие профессии в штатном расписании - нарушение со стороны кадровика.
Насчет СОУТ. В данном случае, никак.
СОУТ делается на каждое рабочее место. В карте прописывается номер кода из классификатора профессий. Нужна штатка, делать СОУТ на каждое рабочее место и знакомить этого сотрудника с двумя картами.
Сегодня он совмещает водителя, завтра другой.
Делать это нужно. Даже если дополнительных гарантий и компенсаций не будет, при НС спросят