А суть претензии от работника в чем? Он, по сути, в плюсе, так как его дни отдыха не оплачиваются сами по себе, а вот при "наложении" на них отпуска - оплачиваются. Если дело только в том, что он хотел отдыхать больше - смотрите на график отпусков, оформление отпуска и тд (все ли было корректно оформлено, а оно, скорее всего. было корректно). Законодательство не запрещает начинать отпуск с выходного после смены, графики составляются на месяц вперед, их никто не знает в момент составления графика отпусков. У него и по-другому могло получиться - с первой смены после отдыха, но выпало вот так. Никто ничего не нарушил, а если ему такой момент был очень принципиален, то нужно было договариваться заранее с кадрами о переносе отпуск на пару дней вперед.
Конечно, можно сказать, что по ст. 107 ТК РФ это разные виды отдыха, что работодатель "лишил" его положенных выходных, но законодательно это необоснованно, нет требования что один вид отдыха не может поглотить другой.