1) В повседневной деятельности, если начальник одного подразделения пытается контролировать работу работника другого подразделения без достаточных оснований (будет соваться не в свою вотчину), это будет превышением должностных полномочий. 2) Поэтому клепайте проект приказа по организации с указанием причин, организации порядка проведения контрольных мероприятий, срока (по возможности), должностей с ФИО. И указать про ознакомление под роспись необходимых ЛНА по этому рабочему месту. Проект приказа утверждайте у Руководителя организации, доводите до заинтересованных лиц. 3) И, если это будет продолжаться длительное время, на всякий случай, можно всунуть этот пункт в Должностную инструкцию контролирующего начальника, т.е. про контроль проведения работ на другом рабочем месте другого подразделения, при отсутствии прямого начальника работника. Это на случай, если тот начальник подразделения не вздумал всякими внутренними совместительствами бредить. 0,1 ставку отсутствующего прямого начальника за контроль требовать. Всяко бывает.