Ответственность за внесение данных несет та организация, чья комиссия проводила экзамен.
Согласно п.17 Постановления Правительства РФ от 13 января 2023 г. №13 «Об аттестации в области промышленной безопасности, по вопросам безопасности гидротехнических сооружений, безопасности в сфере электроэнергетики»
для проведения аттестации ... в ... ведомственных аттестационных комиссиях организация ... (далее - заявитель) представляет ... следующие сведения ...:
...
в)идентификационный номер налогоплательщика заявителя...
Соответственно, при регистрации протокола в системе ЕПТ, он автоматически привязывается к учетной записи и ИНН организации, создавшей этот протокол. Для системы идентификатором выступает именно организация-создатель (заказчик), а не организация, направившая сотрудника (подрядчик).