Воспользуйтесь при составлении приказа пунктом 19 29н:
"Внеочередные медицинские осмотры (обследования) проводятся на основании выданного работодателем направления на внеочередной медицинский осмотр при наличии медицинских рекомендаций по итогам медицинских осмотров и/или после нетрудоспособности работника".
Длительные больничные, как основание, у вас есть, насколько я понял. Рекомендации в виде служебной записки на имя руководителя (если терапевт штатный) также можно взять.
Т.е. у вас будет приказ что-то вроде: На основании п.19 29н и рекомендаций врача-терапевта такого-то направить такого-то на ВМО.