согласен с коллегой выше, в таком случае у Вас будет полностью отсутствовать оригинал протокола.
Протокол подписан всеми участниками с помощью ЭЦП - следовательно оригинал есть в электронном формате. Никаких проблем. НО, если вы такой протокол распечатаете - это будет лишь копия. Не может быть протокол, подписанный с помощью ЭЦП быть в оригинале на бумаге.
Если протокол подписан всему участниками вручную - такой протокол бумажный является оригиналом.
В Вашем случае оригинальный документ отсутствует полностью, как на бумаге, так и в электронном виде.
Полагаю удобнее все таки на бумаге сразу после проверки знаний и заседания комиссии поставить всем свои подписи в протоколе, а далее его подшивать в папку по порядку...
Если есть затруднения на счет сбора подписей членами комиссии - можно рассмотреть вариант с факсимиле. Не изучал досканально вопрос, не знаю точно - насколько легитимно их использовать, мб если в ЛНА прописать, то можно. Надо изучать вопрос.