Стажировка оформляется приказом, направление на обучение тоже приказом.
Проверяющий сверит эти два документа и выявит несоответствие 2464, и может констатировать что Ваш работник не обучен.
Далее проверяющий имеет право выписать вам штраф (до 25000 на начальника, или до 130000 на организацию), и заставить переобучить данного работника (например если при сверке дат в приказе он выявит что работник не мог быть на обучении в УЦ так как в тот же день проходил стажировку на рабочем месте ).
Законный вариант:
Оформляете первичный инструктаж (в журнале), затем приказ на обучение (нужное количество часов с поправкой на программу, помечаете в табеле учёта рабочего времени), после чего приказ о назначении на стажировку, по окончании приказ на допуск к работе.
Но если вдруг случится что работник якобы обучаясь в УЦ дистанционно (что вообще то нельзя так как практики по 2464 не менее 25% должно быть) параллельно работал под присмотром начальника (который чётко понимал что этот работник не обучен поэтому его надо строжайше беречь от всяческих опасностей), и за время такой рабо... в смысле за время прохождения обучения работнику удалось избежать травмирования а работодателю внезапных проверок ГИТ, то можно считать что Вам повезло, и это нарушение останется безнаказанным.
Но вообще то это неправильно, незаконно, и достойно всяческого осуждения и порицания.